软组织肉瘤（STS)，一种可以发生在身体各部位的恶性肿瘤，由于其有70多种组织学亚型，往往难以仅通过组织病理学进行确诊。

　　为了攻克STS精准分型的难题，广州金域基因组检测团队自主研发了RNA融合基因检测panel，并通过研究发现，其检测精准度优于FISH，可作为诊断组织病理无法确定的STS亚型的有力补充。近日，此科研成果发表在国际期刊《Scientific Reports》。

　　软组织肉瘤(STS)指起源于粘液、纤维、脂肪、平滑肌等间叶组织的恶性肿瘤，中国发病率约为3-5例/10万人。其亚型纷繁复杂，不同亚型对于相同或不同治疗策略的响应程度以及预后情况各不相同。基于分子检测技术的个体精准化诊疗，尤为重要。

　　有研究表明，基因组重排所引起的异常融合蛋白是STS发生的重要机制之一。NCCN指南等文献均推荐使用NGS测序检测融合基因，用于STS的辅助诊断。目前，融合基因的检测通常在DNA水平上通过识别断点来判断。然而，DNA内含子过长、GC含量高等因素，会影响其检测效率和准确性，且DNA水平上的部分融合并不会产生异常的转录本。基于DNA法检测基因融合具有一定的局限性。据报道，通过DNA测序，STS患者的融合率分别为10.7%(7/65)、11.6%(68/584)和17.8%(18/102)。

　　为进一步辅助临床精准诊断STS，研究团队考虑二代测序法自研开发肿瘤相关RNA融合panel，并开展了进一步研究。

　　根据COSMIC数据库、NCCN指南及已公布的学术研究，团队选择肿瘤相关常见融合基因作为检测靶点，设计出一款RNA panel。通过纳入2019年4月至2021年12月在临床被诊断为STS的145例患者组织FFPE样本，开展RNA panel、FISH、Sanger测序的对照研究。

　　在RNA panel准确性验证方面，团队在48个人工合成DNA和31个已知融合基因的样本（其中17个为CAP的PT样本，14个经FISH诊断）中进行RNA panel性能验证发现，该panel准确度为98.73%，灵敏度和特异性分别为100%和93.33%。

　　在验证实验中，研究团队发现一例临床表现为多结节性盆腔腹膜肿块并累及肾上腺、肝脏和淋巴结的病例，FISH报告阴性但RNA panel报告阳性，通过Sanger测序进行比对，确认了EWSR1-WT1基因融合的存在。团队成员在回顾FISH图像时发现几个断裂信号，但由于样本切片质量较差导致的细胞堆积不易单独计数，因此结果报告为阴性。这提示：RNA panel可以作为FISH检测的补充，以减少假阴性结果的报出。

　　在诊断功能评价试验中，研究团队发现一例病例免疫组化显示CD56、CD10和CD117呈阳性，在某些区域Ki67指数高(约50%)，但常用于肿瘤亚型诊断的多种免疫组化指标均呈现阴性，因此无法进行判断。为进一步验证，团队成员使用RNA-panel鉴定发现ACTB-GLI1融合基因，已有研究表明此基因融合发生在部分上皮细胞肿瘤中。结果提示：RNA panel可协助诊断免疫组化无法分类的STS肿瘤亚型。

　　苏木精伊红染色(HE)和免疫组化(IHC)。胃壁肿瘤的组织学图像:(a) 100倍镜下，可见单核细胞，细胞核圆形至卵圆形。(b) 100倍镜下，肿瘤细胞形成具有黏液样背景的腺泡样结构。(c)在200倍镜下，肿瘤细胞中CD10的表达。(d) 200倍镜下，肿瘤细胞中CD56的表达。(e) 200倍镜下，CD117在肿瘤细胞中呈弱阳性。(f) 200倍镜下，肿瘤细胞Ki-67增殖指数升高。

　　STS在分子水平、组织学、临床特征和治疗反应方面的异质性使诊断这类罕见而多样的肿瘤更加具有挑战性。

　　通过此次研究，金域医学603882）创新建立起一款用于辅助STS分类诊断的RNA panel。与FISH等检测方式相比，RNA panel在检测融合基因方面的灵敏度和准确性有了实质性的提高，可补充诊断组织病理无法确定的STS亚型，对于提升STS整体诊疗水平具有积极意义。金域医学将以此RNA panel的研发为契机，发挥自身优势，造福更多患者。