本期文章：《自然—遗传学》：Online/在线日，《自然遗传学》杂志在线发表了美国丹娜-法伯癌症研究所Alexander Gusev小组的最新成果。该研究发现，癌症中染色质可及性的等位基因不平衡可确定候选因果风险变异及其机制。

　　研究人员使用了跨越23种癌症类型的406个癌症ATAC-Seq样本，并确定了7262个种系等位基因特异性可及性QTL（as-aQTL）。癌症as-aQTL对癌症风险遗传性的富集程度（高达145倍）超过了七个癌症全基因组关联研究（GWAS）的任何其他功能注释。大多数癌症as-aQTL直接改变了转录因子（TF）模体，并在功能筛选中表现出不同的TF结合和基因表达。

　　为了将as-aQTL与假定的风险机制联系起来，研究人员引入了调控组关联研究（RWAS）。RWAS在70%以上的已知乳腺和前列腺位点上发现了遗传相关的可及峰，并在所有被检查的癌症类型中发现了新的风险位点。综合as-aQTL发现、模体分析和RWAS确定了候选的因果调控元件及其可能的上游调节因子。这项工作表明，癌症as-aQTL和RWAS分析是研究癌症风险遗传结构的有力工具。

　　据介绍，虽然通过GWAS发现了许多种系癌症风险变体，但这些变体的运作机制在很大程度上仍是未知的。

　　Title: Allelic imbalance of chromatin accessibility in cancer identifies candidate causal risk variants and their mechanisms